(1) AONDE / (2) ONDE

(1) Usa-se com verbos que dão ideia de movimento. Equivale sempre a “para onde” -> Ex.: Aonde você vai?
(2) Usa-se com verbos que não dão ideia de movimento -> Ex.: Onde estão os remédios?

(1) AUTO / (2) ALTO

(1) Significa "próprio de si mesmo". -> Ex: tenho uma baixa autoestima.
(2) É o contrário de "baixo". -> Ex: o homem é alto.