(1) AUTO / (2) ALTO

(1) Significa "próprio de si mesmo". -> Ex: tenho uma baixa autoestima.
(2) É o contrário de "baixo". -> Ex: o homem é alto.

(1) EXTINTO / (2) INSTINTO

(1) Algo extinto é que não existe mais, que acabou. -> Ex: Os dinossauros foram extintos há milhões de anos.
(2) O instinto é o impulso natural, é a tendência que temos de responder automaticamente a algo. -> Ex: Ele agiu por instinto.